北卡罗来纳大学莱恩伯格综合癌症中心的研究人员开发了一种新的综合方法来确定癌症的遗传“驱动因素”,揭示了8个可能用于靶向乳腺癌治疗的基因。
这项研究于8月24日在线发表在《自然遗传学》杂志上,作者是迈克尔·加扎博士,他是第一作者和博士后研究助理;研究生Grace Silva;Joel Parker博士,UNC Lineberger生物信息学主任;程帆,研究助理;资深作者Chuck Perou,遗传学和病理学教授。
这些研究人员研究了多种致癌途径,包括控制癌细胞生长速度的途径,包括正常细胞转变为癌细胞的逐步遗传改变。细胞的高生长速度,也被称为细胞增殖,被认为与乳腺癌患者的不良预后有关。
通过分析多种类型的基因组数据,UNC Lineberger的研究人员能够识别出八个基因,这些基因在基因组DNA水平上被扩增,并且对于腔室乳腺癌(乳腺癌最常见的亚型)的细胞增殖是必要的。
“使用这种新的计算方法,我们能够利用现有的丰富数据资源,并为特定的乳腺癌患者子集确定一些新的潜在药物靶点。这是迈向更个性化医疗的重要一步。”
事实上,其中一种被发现的基因——CPT1A——已经成为淋巴瘤药物开发的目标,也可能被用于乳腺癌患者的测试。靶向CPT1A的药物已在体外和小鼠淋巴瘤模型中显示出抑制人类癌细胞系生长的作用。
这种用于更好地理解癌症驱动因素的分析方法包括对多种数据类型的全面综合分析,包括基因表达数据、体细胞突变、DNA拷贝数和功能基因组学数据集。
虽然这项研究的重点是确定乳腺癌的遗传驱动因素,但这种方法也可以很容易地应用于其他类型的肿瘤。该研究的主要作者迈克·加扎补充说:“虽然我们能够确定乳腺癌的驱动因素,但这种方法将来可以也将应用于其他类型的肿瘤。”