昆士兰科技大学博士研究员Zachariah Schuurs表示,研究小组已经在SARS-CoV-2刺突蛋白上发现了一个新的结合位点。
“CoV-2刺突蛋白与细胞表面硫酸肝素(HS)的结合通常是病毒启动感染并进入细胞所需的一系列相互作用的第一步。
“大多数研究都集中在了解HS如何与SARS-CoV-2病毒刺突蛋白的受体结合域(RBD)和furin切割位点相互作用,因为这些通常与不同类型的药物、疫苗和抗体结合。
“我们已经在n端结构域(NTD)上发现了一个新的结合位点,这是病毒刺突的一个不同区域,促进了HS的结合。这有助于更好地了解病毒是如何感染细胞的。NTD也是刺突蛋白中经常发生突变的一部分。
“血液中一些中和病毒的抗体与NTD的同一区域结合。
“因此,用肝素(或肝素模拟物)等分子靶向NTD位点是一种可能阻止病毒与细胞结合并感染细胞的策略。肝素是一种已知的抗凝血药物,类似于HS。”
来自昆士兰科技大学基因组学和个性化健康中心的尼哈·甘地博士说,尽管covid - 19疫苗在全球取得了成功,但仍远未普及。
流行病学家认为,许多国家持续的低疫苗覆盖率将更有可能出现疫苗抗性突变。
南非、美国、印度和巴西已经出现了不同形式的担忧。在这方面,迫切需要其他抗病毒策略来预防COVID-19的传播和治疗COVID-19患者。
“大多数SARS-CoV-2变体在刺突蛋白中获得了带正电的突变。像肝素及其模拟物这样的分子带负电荷,因此,这些分子可以用来治疗受到病毒严重影响的人以及任何新出现的变种。
“我们的研究表明,具有不同硫化学成分的模拟肝素3D结构的分子,可能通过与病毒本身的直接相互作用,成为COVID-19和其他新兴病毒威胁的潜在广谱抗病毒药物。”
发表在《计算与结构生物技术杂志》上的这项多国研究题为“糖基化SARS-CoV-2刺突蛋白n端结构域上假定的糖胺聚糖结合位点的证据”,该研究使用计算和实验技术来证实他们的发现。
研究人员使用NCI Gadi和QUT Lyra超级计算机来模拟HS及其抑制剂(如肝素)如何与刺突蛋白相互作用。
来自昆士兰大学(糖化学)、科廷大学(免疫学)、祖塞罗制药公司和昆士兰科技大学的各种研究人员对这项研究进行了概念化。QUT研究小组进行的这些计算分子模拟测试并证实了一种假设,即硫酸肝素可以在新发现的结合位点和病毒感染中重要的刺突上的另一个位点之间形成一座桥梁。